Монастырь был основан как мужской в 1635 году царём Михаилом Фёдоровичем. Здесь действовал первый Миссионерский институт, для посетителей которого в XIX веке была открыта гостиница. После октябрьской революции в здании располагались магазины и органы государственной власти. В 1980-х годах здание обветшало и его снесли, а в 2015 году возвели вновь. В настоящее время гостиница принимает не только паломников и миссионеров, но и молодоженов: здесь можно зарегистрировать брак.